Estudio y evaluación de algoritmos y programas de ensamblaje de secuencias

Abstract

Trabajo fin de Máster dirigido pro Manuel Gonzalo Claros Llanos. Los objetivos del proyecto son los siguientes: a) Realizar un estudio sobre los métodos de ensamblaje, teniendo en cuenta su componente teórica (algoritmos y heurísticas utilizadas) y su desarrollo en programas de ensamblaje (origen, investigación, desarrollo, referencias iniciales y actuales, y futuro del método). b) Evaluar desde un punto de vista teórico los distintos programas de ensamblaje de secuencias, observando tanto los comerciales como los de libre distribución, clasificando su desarrollo, construcción, objetivos, uso, aplicación, referencias, funcionamiento (fiabilidad, rendimiento, consumos, …) y previendo futuro del programa. c) Instalar y evaluar el funcionamiento de los programas más habituales de ensamblaje de secuencias, teniendo en cuenta su acceso a los mismos. El método de trabajo será principalmente la recopilación de información sobre los algoritmos y programas de ensamblaje de secuencias y la instalación de los programas que se puedan descargar, instalar y ejecutar en plataformas Linux y Microsoft o bien en entornos Web.