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Análisis bioinformático de genes implicados en replicación en genomas de bacterias endosimbiontes
(2010)Tesis dirigida por Enrique Viguera Mínguez. La cantidad de DNA se correlaciona positivamente con la complejidad genética del genoma del organismo. Algunas bacterias endosimbiontes de insectos y moluscos han sufrido un ... -
BlaSTorP : herramienta NCBI-BLAST a nivel local
(2010)Tesis dirigida por Antonio Jesús Pérez Pulido y Juan Falgueras Cano. Se ha desarrollado una nueva herramienta bioinformática con el fin de resolver los problemas que el investigador novel en proteómica y bioinformática ... -
A First-Stage Approximation to Identify New Imprinted Genes through Sequence Analysis of Its Coding Regions
(2010)Investigación dirigida por Antoni Romeu y Oswaldo Trelles. In the present study, a positive training set of 30 known human imprinted gene coding regions are compared with a set of 72 randomly sampled human nonimprinted ... -
Estudio y evaluación de algoritmos y programas de ensamblaje de secuencias
(Universidad Internacional de Andalucía, 2011)Trabajo fin de Máster dirigido pro Manuel Gonzalo Claros Llanos. Los objetivos del proyecto son los siguientes: a) Realizar un estudio sobre los métodos de ensamblaje, teniendo en cuenta su componente teórica (algoritmos ... -
"Smith-Waterman" paralelo en arquitectura de many-core para búsquedas en bases de datos de secuencias
(Universidad Internacional de Andalucía, 2011)Trabajo fin de Máster dirigido por Sergio Gálvez Rojas, y co-tutores: Oswaldo Trelles Salazar y Gabriel Dorado Pérez. En este trabajo se ha desarrollado un algoritmo denominado MC64-S3W (MultiCore 64 – Sequence Search ... -
Análisis bioinformatico de vías de transducción humanas con identificación de parálogos en contexto transcriptómico
(Universidad Internacional de Andalucía, 2012)Trabajo fin de Máster dirigido por Javier de las Rivas y Toni Gabaldón. Las vías metabólicas y de señalización presentan una información experimental de forma clara y eficaz. Su procesamiento y análisis bioinformático es ... -
Identificación de regiones hipervariables de bacterias patógenas mediante herramientas bioinformáticas. Aplicación en el genotipado bacteriano
(Universidad Internacional de Andalucía, 2012)Trabajo fin de Máster dirigido por Enrique Viguera Mínguez. La gran mayoría de los genomas de organismos procariotas analizados hasta la fecha poseen secuencias de DNA repetidas. Estas repeticiones se localizan tanto en ... -
Variabilidad natural de la Isla Genómica 1 de "Haloquadratum walsbyi"
(Universidad Internacional de Andalucía, 2013)Trabajo Fin de Máster. Tutores: Francisco Rodríguez Valera y Enrique Viguera Mínguez. El presente trabajo presenta el análisis bioinformático de varios fósmidos pirosecuenciados pertenecientes a una zona muy concreta del ...